Virus im MBR?

Hallo Leute.

Also folgendes: Ich hatte einen Virus auf meinem Rechner und konnte diesen nicht entfernen also hab ich mich entschieden den guten mal wieder platt zu machen. Leichter gesagt als getan. Plötzlich konnte ich nicht mehr mit der Windows CD starten, hab die Festplatte also als externe angeschlossen und übern den Arbeitsplatz -> Rechtsklick -> Fomatieren platt gemacht. Hat soweit auch funkioniert, aber nun wollt ich ihn neu aufspielen, bzw Windows neu aufspielen und es passiert immernoch das gleiche... Sobald er fertig von der CD gebootet hat und eigentlich das "Menü" kommt in dem man die Festplatten formatieren, partitionieren usw kann kam wieder der Bluescreen.
Komischerweise passiert das nur wenn ich Windows drauf installieren will... OpenSuse, Debian usw funktioniert alles einwandfrei.
Nun wurde mir gesagt das es sein kann das ich einen Virus im MBR habe.. Hab mal mit sämtlich Virenscanner Boot CDs gebootet aber die haben alle nichts gefunden...
Ich hoffe mal hier hat jemand eine Idee was ich da machen kann!

MfG Inv151673